Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms