Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms