Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cabp4Q8VHC5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms