Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms