Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps4aQ8VEJ9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms