Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmcd1Q8VEE1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmcd1Q8VEE1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms