Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms