Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TgdsQ8VDR7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TgdsQ8VDR7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TgdsQ8VDR7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TgdsQ8VDR7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TgdsQ8VDR7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TgdsQ8VDR7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TgdsQ8VDR7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms