Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms