Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms