Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rnf183Q8QZS5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf183Q8QZS5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf183Q8QZS5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf183Q8QZS5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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