Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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