Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lrrtm1Q8K377 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lrrtm1Q8K377 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lrrtm1Q8K377 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Lrrtm1Q8K377 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lrrtm1Q8K377 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lrrtm1Q8K377 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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