Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms