Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms