Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa5Q8C7G5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms