Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C5C9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C5C9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C5C9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q8C5C9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q8C5C9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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