Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms