Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3Q8BRE0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3Q8BRE0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3Q8BRE0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3Q8BRE0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3Q8BRE0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3Q8BRE0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3Q8BRE0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3Q8BRE0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3Q8BRE0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3Q8BRE0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3Q8BRE0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3Q8BRE0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3Q8BRE0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3Q8BRE0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms