Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms