Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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