Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms