Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms