Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms