Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnupnQ80W37 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnupnQ80W37 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms