Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ1

Slc22a20, Solute carrier family 22 member 20, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a20Q80UJ1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a20Q80UJ1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a20Q80UJ1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms