Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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