Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms