Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms