Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim17Q7TPM3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms