Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp397Q7TNK4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp397Q7TNK4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms