Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms