Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms