Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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Atp8b3Q6UQ17 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Atp8b3Q6UQ17 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Atp8b3Q6UQ17 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Atp8b3Q6UQ17 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Atp8b3Q6UQ17 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Atp8b3Q6UQ17 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b3Q6UQ17 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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