Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms