Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd4Q6PDQ2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd4Q6PDQ2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms