Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms