Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms