Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms