Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms