Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms