Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PtprdQ64487 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PtprdQ64487 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PtprdQ64487 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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PtprdQ64487 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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