Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms