Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Znf260Q62513 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Znf260Q62513 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf260Q62513 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf260Q62513 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Znf260Q62513 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf260Q62513 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf260Q62513 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf260Q62513 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf260Q62513 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Znf260Q62513 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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Znf260Q62513 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms