Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms