Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ss18Q62280 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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