Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sox19Q62249 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sox19Q62249 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sox19Q62249 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sox19Q62249 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sox19Q62249 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sox19Q62249 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sox19Q62249 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sox19Q62249 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sox19Q62249 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sox19Q62249 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sox19Q62249 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox19Q62249 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sox19Q62249 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sox19Q62249 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox19Q62249 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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