Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema3bQ62177 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3bQ62177 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms