Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms