Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HlxQ61670 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HlxQ61670 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HlxQ61670 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HlxQ61670 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HlxQ61670 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HlxQ61670 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HlxQ61670 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HlxQ61670 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HlxQ61670 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HlxQ61670 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HlxQ61670 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HlxQ61670 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HlxQ61670 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HlxQ61670 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms